Je viens de regarder sur ma version de VLC (2.2.6)
Lors de l'export, tu fais convertir, ensuite modifier le profile (l’icône en forme d'outil)
Sur la nouvelle fenêtre, coche "Conserver la piste audio originale" qui est décochée dans l'onglet "Codecs Audio"
Enregistrer.
En théorie ça devrait ré-encoder ta vidéo avec la piste son originale.
En espérant avoir aidé